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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已呈现出丰富的生物技术几丁质酶，收录抗肺部肿瘤和抗病力毒使用。常常，三萜是采用甲羟戊酸行业合成图片的，并从当然草本花卉和细菌中导入。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上刊出了题写“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的深入分析文章。该深入分析发掘三萜类氧化物虫草酸（GA）是在介质液体培養的无柄虫草菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的海洋生态学被转化出现的。实现转录组和营养素质组学系统进一部科学探索无柄野生虫草菌丝体中DHT出现两种类型野生虫草酸（GA）的机制化，并依据几组学系统探测到的不同之处dna和不同之处营养素，估测DHT 海洋生态学提炼 GA 的经由。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录类物质析和功能性分类管理

使用对无柄灵芝粉真菌感染菌丝体参与转录组测序共取得67230个转录本和14297个单什么是基因组遗传。在许多单什么是基因组遗传中，491个被判定为不一致性表述什么是基因组遗传（DEGs），这各举213个表述上浮，279个表述调低（图1A）。GO聚集阐述后，DEGs包括海洋生物工作（BP）、生殖细胞核物质（CC）和分子空间结构实用功能（MF）3类。在BP类目中，存在了前五个子类目：抗菌素拆分分解分泌转化工作，醋酸钠盐分解分泌转化工作和甲酸盐分解分泌转化工作;而在CC类目中，生殖细胞核外区、突触组合体、突触空间结构是前五个亚类。这对MF类目，甲酸脱氢酶（NAD）活力、空气氧化还原系统酶活力和酸氨（或酰胺）连到酶活力是前五个亚类目（图1B）。在DEGs的KEGG径路阐述中，前30条聚集度最底的径路有27条专属分解分泌转化，这各举二氧化氮分解分泌转化、乙醛酸盐和二羧酸盐分解分泌转化、丙酸盐分解分泌转化警报径路更为明显聚集（图1D）。

图1|转录类物质析和的功能的分类

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

经由对无柄野生灵芝真菌孢子菌丝体对其展开蛋清质组学介绍，总计确实了16,457种独有肽、2606种蛋清质和2588种定量浅析蛋清质。在域值|FC|>1.2和p<0.05的选择必要条件下，这2606种蛋清质中，94种被亲子鉴定为距离表述蛋清（DEPs），在这当中52种上浮，42种降低（图2A），图2C展现了距离表述蛋清的聚类浅析介绍热图。从GO介绍来瞧，BP行业类型展现，大多都数DEPs积极参与冰醋酸盐产生转化进程、四环素转换产生转化进程和用药转换产生转化进程。CC类DEPs在神经元外区、过阳极铁的空气氧化物酶体和微体中比重更高，阳极空气氧化完美重现酶可溶性和甲酸脱氢酶（NAD）可溶性在MF类中DEPs的配比更高（图2B）。与转录组没想到一样，KEGG径路介绍展现，大多DEPs在产生转化中聚集，在这当中3条最聚集的路线是光合生态学工程中的碳固定位系统置、碳产生转化和MAPK数据报告径路（图2D）。然而，经由介绍GO数据报告库的CC对DEPs对其展开亚神经元定位系统介绍和参考文献标注（图2E），DEPs主耍分布点在神经元质（40.66%）、神经元膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），理论研究上是GAs生态学工程获得的主耍地点。

图2|血清质组的按量深入分析和技能查证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

过活物转为和比较组得票数DEGs和DEPs创作了维恩图，有20个对比研究表现表观遗传组（图3A）。对转录组和膳食纤维质组中E组和C组总共的DEGs/DEPs做聚类研究研究，出现mRNA和膳食纤维质间有17个调涨表观遗传组和7个变动表观遗传组，DEGs与此汉语翻译的DEPs表现平行呈正一些，应用于Pearson的一些弹性系数研究，在转录组和膳食纤维质组间验测到较为较高的一些性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）检查测量结杲提示，E组和C组13个DEGs的抒发方法层次对比相关系数，进来9个为上浮DEGs，5个为再降DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的抒发方法未来趋势与转录成分析结杲共同。

图3|球膳食纤维组的化学发光法分享和的功能认证

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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