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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于表面抗原种群特女性朋友、寡核苷酸淡化直接费用非常高或操作使用的流程错综复杂。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教援开发团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个高产出投入、跨鱼类、全机构兼容的全新解决方案。

学术期刊百科

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由国内海洋生物工程工程基地隐性基因病与阴茎发育海洋生物工程工程学研发探讨所和国内隐性基因病学好协办的展览科研研发杂志论文,专业专注于了解生活海洋生物工程工程学和海洋生态学隐性基因病学行业教育这个领域的原汁原味性研发探讨科研成果。JGG 2026年度不良影响指数公式7.1,Scopus科研研发杂志论文评论评价指标CiteScore 9.9,名列JCR 2026年度GENETICS & HEREDITY行业教育这个领域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY行业教育这个领域Q1区,名列国内海洋生物工程工程基地杂志论文磁盘分区海洋生物工程工程学大类别1区(Top杂志论文),隐性基因病学和生化模式与碳原子海洋生物工程工程学小类双1区。

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什么东西是HEATag

完美的“二合二为一”设计制作

HEATag是由凝集素和HUH内切酶组成部分的就结合球蛋白

「地位器」摸块 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化突显(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「衔接器」电源模块 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)检索方形码进行共价拼接。

“1+1>2”的成效:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行模本标志与可追溯。

Fig1: HEATag多厚记号方法提醒图

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实战经验产品检验

HEATag真的有大多能打?

不错在与众不同水平下,构建蒲乳期哺乳动物神经体细胞系单神经体细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。钻研销售团队为 HEATag 设施了多轮 “工作压测方法”,从组织肿瘤细胞系到组织肿瘤细胞结构,从超常温到常温,从新鲜样品到放置样品,全方向认可它的动态平衡性和安全性。

第一个轮测试测试对於辅乳猎物内部系:的研究工人抉择了来自于人、鼠、仓鼠几个种类的4种内部(HEK293T、K562、MEF、CHO),在空调温度下使用 HEATag 符号后混合着测序。既定回收分类处理的 11447 个内部中,85.66% 都能经由 HEATag 条型码合理相一致到原种类,样版间交叉重合被污染很少,UMAP 聚类介绍介绍也是可以说明,HEATag 条型码与种类特男人基因遗传组表现角度相一致。 随后,检验前提状态进一部升极:研究方案的人员试穿在 4℃下箭头优质細胞、在室内温度下箭头甲醇确定的細胞,乃至真接箭头細胞核。可是一如既往精彩:整个前提状态下,范本价签与外来物种个人信息均有非常好的的有关于性,拆成精确率超 95%。虽然甲醇确定的会产生重度的转录本双向环境污染,細胞核配制会出少量的 RNA 人才流失,細胞方式的注解可是一如既往与优质范本增加一直,认定书 HEATag 就可以箭头各种不同除理前提状态下的实验所范本。

Fig2: HEATag 可在各种要求下做完单神经细胞转录组混样分折

可能图标乳期生物和海洋能无脊梁骨生物的原代上皮细胞

倘若说人体细胞膜系检验是 “基本知识题”,那公司模板就是说 “扩展题”, 此类模板并不因人体细胞膜类行繁琐、生活环境认知性特俗,成为了标签技术工艺的 “困难”,而 HEATag 正好在此类 “困难” 上浮现了优势可言。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸集体,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不仅仅能被合理辨别,所有关键体细胞业务类型的聚类分析法导致都清洗可辨。

更令人惊喜的是HEATag对海洋资源生态学的替换性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 长形码与种类转录组有较高不对性,不会有产生因高盐工作环境会导致的 “标示出现异常”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可实行喂乳小动物策划 样本量多个 scRNA-seq 解析

Fig4: HEATag可达到鲜新海洋资源无脊椎骨宠物多方面 scRNA-seq 剖析

HEATag与神经元的整合没进而引发转录组的可观改动

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在达成标上的任务的此外,没对之后的的转录类物质析出现干涉,能保证了学习数据信息的真实度性。

Fig5: HEATag不想的影响子样本的 RNA 展示形式

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前景可期

HEATag 能为单生殖细胞理论研究给我们有什么?

HEATag 的价值量,远不停于 “来解决标记符号一些问题”,它的灵活机动性和共通性,在为单神经细胞探索张开更高有概率

从应用软件情境看

HEATag 能所覆盖从 “简约非常探讨”(如癌聚集与一切正常聚集、药处置与相较比较)到 “大总量探讨”(如聚集細胞图谱制图、高通芯片量建立)的全範圍供给。由于 PIP-seq、Stereo-cell 等新颖可映射的技术的开发,HEATag 还能进一个步骤提高单細胞探讨的通量,助推成果转化团对展开更广总量的好项目。

从跨科技领域提升空间一起来看

HEATag 一方面适用性于转录组学,还能与表观遗传基因组学、蛋白酶质组学、服务器组学等系统相结合,采用制定目录和寡核苷酸编码序列,HEATag 是行简单融进不一的组学方法,不干扰数据信息驯服的深度。一同,根据HEATag还是行成长单上皮细胞糖组学钻研系统。

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进行合作日常动态

拜谱微生物与陈凯讲师达到目标逐项战略合作有意愿

值得购买注意的是,在 HEATag 的新技木展现什么出极大使用前景的背景图片下,拜谱微生理学已与江苏地区海上学科与水利江苏进行实践室内(郑州)陈凯副教授确定第一次进行项目合作意向性。夫妻之间预计努力实现 HEATag 的新技木的产业群化落地实施、教学研发项目转化成等方面展开图厚度分工协作,促进改革这一项成本低的费、跨种群的单人体神经元膜记号的新技木很快使用于实际情况教学研发项目情况,为多进行实践室内具备效率高、划算的单人体神经元膜实验辅助工具,推助教学研发项目工作的者在人体神经元膜微生理学学、海上微生理学学、症状缘由等区域拿得多推动
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