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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T集体化血神经血集体集体膜膜都可以设别良性肿癌集体化血神经血集体集体膜膜从表面的常见集体化相融性组合体(MHC)呈递的抗原而触及免役不良反应。MHC I类(MHC-I)原子结构与CD8+ T集体化血神经血集体集体膜膜也可以 目的,其呈递的肽常见由来于内源性胞质球蛋白酶酶的球蛋白酶酶酶体分解,而MHC II类(MHC-II)原子结构常见传达于专业课程抗原提呈集体化血神经血集体集体膜膜,与CD4+ T集体化血神经血集体集体膜膜也可以 目的,其呈递的肽来在内体有效的途径分解的胞外和胞内球蛋白酶酶(图1)。这样,设别由MHC原子结构呈递的良性肿癌抗原而对于设置依懒T集体化血神经血集体集体膜膜设别和杀掉良性肿癌集体化血神经血集体集体膜膜的有效的和安全可靠的癌症免役的治疗方法是至关更重要的。立于质谱(MS)的免役肽组学(Immunopeptidomics)都可以从多类集体化血神经血集体集体膜膜系、良性肿癌集体化和健康生活集体化中高通芯片量、随时亲子鉴定MHC结合实际肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC抗原丰度MHC极其组合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫检测肽字段相应全文翻译后绘制信息,提高基因测序的真实度,并采用De novo从脚测序枝术,不依赖现有数据库,高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多的数据进行分析进行分析项目为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递肺部肿瘤抗原的经过

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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范例研究

01 长效机制理论研究

文章标题标题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

投稿期刊杂志:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)是一种种核的输出淀粉酶,在癌证中常常过表达出来,做以为癌症产生的驱动包基本要素。迄今为止,靶向肿瘤药物XPO1的小氧分子正被用来临床研究治疗癌症肿瘤药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用天然免疫肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 一种生活出于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 良性肿瘤-免疫力方法

篇文章主题 :Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

刊发月刊:Nature Communications IF:16.6 2023

恶性瘤胸膜间皮瘤(MPM)是种疗法作用异常情况的入侵性淋巴肿瘤。考虑到现存的进行疗法工作方案贫乏疗法作用,因而十分困难必须要新的进行疗法政策。主要是因为其T组织浸润性,我们统计假设MPM是个靠谱的进行疗法性肿瘤役苗的受众。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用依据质谱的抗体肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶变胸膜间皮瘤免疫细胞肽组学检查

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 微生物mRNA预苗联合开发

文章标题题:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

发表文章杂物:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过应用场景质谱的免疫力肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌沾染的Hela组织和HCT-116组织中司法鉴定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱个人总结

抗体肽组学是淀粉酶酶质组学的一名迅猛经济发展的分支节点,它专心于探讨抗体整体中由包括团体混溶性软型体(MHC)或人类白血球系抗原(HLA)大分子呈递的抗体肽。以下抗体肽是神经元系外层呈递的肽段,会被T神经元系判断,才能引起抗体影响。应用场景质谱的抗体肽组学早就加入亲子签定MHC淀粉酶酶呈递肽的金规范标准方式,会就直接亲子签定的其他生理方面和病理报告模式下的其他团体和神经元系品类中的抗体肽组,如三维线瘤或木马感染支原体的神经元系。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的淀粉酶组学、代谢转化组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫论文检测肽组论文检测精准服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,要能正确且会直接可以提供天然免疫性肽队列,挖掘大多非类型天然免疫性肽,一层层挑选出可以信赖新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

关联性文献资料

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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