
近日,东莞医科高校第1附屬医院科室王学浩院士评选团队协作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶点热量消化吸收检测分析服务。
因为名称:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
中文名字副标题:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
买家基层单位:南京医科大学
探索村料:细胞
拜谱出具贴心服务:转录组测序+蛋白酶互作组+靶向药物消耗的能量代谢转化组
系统自驾线路:
科研报告单
01、YBX1被鉴别为HCC中糖酵解的至关重要人类基因
本学习爬取HCC淋巴肉瘤样例(n=7)的单生殖神经神经细胞RNA测序数据库表格集去分享,遇到糖酵解生物具体集中授课在淋巴肉瘤生殖神经神经细胞中,hdWGCNA分享设别出9个人类基因引擎(图1A-G)。TCGA-LIHC序列的发展分享判定YBX1为经济独立发展危险 的因素(图1H)。进一部综合IHC、WB研究和淋巴肉瘤企业与周围非淋巴肉瘤企业的余地转录组学数据库表格集印证YBX1是肝生殖神经神经细胞癌根治的潜在性的靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被制定为调节器HCC组织细胞糖酵解的主要原则
02、YBX1带动HCC中的有氧糖酵解和增值能力
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶点力量新陈代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1推进HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1紧密联系并催进YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,蛋清互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密联系并有助于YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化不断增强其磷过酸,故而有利于其核转位
进几步测量YBX1的O-GlcNAc糖基化是否是影响到其磷硝化作用,在OGT敲低的HCC神经细胞膜中或用OGT减缓剂OSMI-1净化解决,YBX1核蛋白酶质情况相关性影响,YBX1磷硝化作用相关性才能减少(图4A-C)。IP检测体现,在一样的的Flag-YBX1底物情况下,YBX1-WT的磷硝化作用情况相关性超过YBX1-T57A,表述磷硝化作用的曾加不实际上仅是可能高的YBX1核蛋白酶质理解方式(图4D)。离心分离了核和质成分挖掘TMG净化解决的HCC神经细胞膜中YBX1核理解方式的上升(图4E-F),进几步挖掘YBX1磷硝化作用的重要的调节器指数公式是AKT(图4G-I)。这样的挖掘透露O-GlcNAc糖基化用可以淡化其磷硝化作用来加强YBX1核蛋白酶质平稳性并可以淡化核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 呈现重要于其进一大步的发生磷硝化作用呈现并能够可以淡化其核转位
05、YBX1提高PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1有利于促进PKM2转录
06、YBX1 能够增强组蛋白酶乳酸性反应表达横向
探析表明YBX1敲低特殊大大减少血清酶质乳过酸,十分是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解仰制作用剂2-DG的试验查证了糖酵解与组血清酶乳过酸的马上关系,仰制作用糖酵解可特殊大大减少H3K18la技术水平(图6D)。PKM2过表示不可逆转转YBX1敲低导致的的H3K18la下跌,之外源乳酸正确处理这不仅升高H3K18la,还随YBX1表示上涨,建议长期存在正向着上报(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR查证,H3K18la使用生物富集于YBX1重启子马上力促其转录,该的过程 受O-GlcNAc糖基化房产调控(图6H-J),并表明P300 上涨是YBX1明显增强H3K18乳酰化做用的制度(图6K-L)。
图6.YBX1资料H3K18乳过酸淡化平行
稿件总结ppt
在上述设计中简讯了YBX1在HCC中高描述,以及与糖酵解析切关于。YBX1在T57处被O-GlcNAc体现,得以安全球营养物质并提升其描述。一些体现还使得YBX1在T57处的磷碱化,使得其核易位。那么,上述时明显增强了糖酵解关于遗传人类基因的转录并的刺激乳酸的引发。虽然,YBX1激活开通P300的转录,以致带动组球蛋白质的乳碱化,独特是H3K18la,H3K18乳碱化顺向干预YBX1遗传人类基因转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传性正反面馈环逻辑图
拜谱个人心得体会
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱生物学为该研究提供了转录组测序,蛋白酶互作组和靶向治疗能源新陈代谢组技术服务,拜谱生态学建立了完善成熟的转录组学、血清组学、反译后表达组学、消化吸收组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
参阅文献综述
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.