在人类细胞中，DNA充满了组蛋白、RNA和染色质相关蛋白，形成粘性凝胶。在任何给定时刻，只有蛋白质组的一个子集可以结合DNA并组织其结构、转录、复制、修复和其他基本分子功能。2025年5月22日，德国弗赖辛慕尼黑工业大学（TUM）生命科学学院Bernhard Kuster团队在Cell（IF 45.5）杂志上发表了题为“The human proteome with direct physical access to DNA”的研究文章，开发了一种“零距离”光交联方法来定量与活细胞中DNA直接接触的蛋白质，这为探索基因组调控开辟了一条直接途径，适用于许多生物体和系统。

设计的结果

1、从光敏激发细胞膜中提现DNA化学交联蛋清质

成了分开光交连血清质-DNA分手后复合物采用LC-MS定性进行分析，小编开发技术了了种变形纯化情况报告，可从DNA中快速清理非是交连血清质，仅在直晒时确认来进行基因遗传组交往丰度DNA交连血清质。用TRIZOL快速清理复染质并快速清理落网获的非交连血清，再将其重拾容解以来进行RNase肠蠕动不良。确认超声心动图削切应纳税所得额血清质交连DNA的快速清理物，在硫氰酸胍中煮开变形，并在二阳极氧化硅离心法柱上急促洗衣以快速清理非是交连血清质直接左右已完成。确认核酸酶正确处理从DNA中释放出光交连血清，并来进行胰血清酶肠蠕动不良采用LC-MS定性进行分析。该工艺创建为血清质交连DNA快速清理或XDNAX。

图1.核膳食纤维热塑DNA导入或XDNAX方法图（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

2、可随便使用DNA的球营养素图谱

将光化学交联的办法采用于MCF7癌细胞核，出现了1,805种待选淀粉酶酶酶质，在这其中1,191种普遍存在于3个或太多次多个中。60%的DNA相互间帮助组有核酸融合的GO引用，在不足核酸融合引用的淀粉酶酶酶质质中，很大的影响力存在核纤层淀粉酶酶酶质，二是参与到刺绣质组织开展和癌细胞核裂变的淀粉酶酶酶质质（图2）。

图2 . 可之间碰到 DNA 的蛋清质（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

图3工作小结了DNA能够 目的组所暗含的球营养物质-DNA游戏界面以及其分为的核苷酸化学交联肽。这有仍然（1）球状DNA根据结构设计域、（2）DNA 根据起居不规律区（IDR）和（3）仍然与其它的球营养物质（诸如组球球淀粉酶质含量根据球球淀粉酶质含量）、RNA（诸如剪接因素）或相分離区室（诸如核仁球球淀粉酶质含量）能够 目的而形成的周围环境将近。

图3 . 可同时接觸 DNA的设备构造域（改自：Trendel, et al., Cell 2025）

3、化学发光法组织扰动阶段与DNA整合的转录因素

雌生长荷尔蒙淀粉酶激酶α（ESR1）驻回到胞质溶胶中，终会面临其配体，晕人易位到肿瘤组织生殖细胞，在哪里它与dna组中的某些区结合起来以激活卡某些的转录编译程序。将血清饥饿的MCF7肿瘤组织生殖细胞外露于高服用量雌生长荷尔蒙（10 nM 17β-雌二醇）44分钟的英文，与模拟系统清理的比对肿瘤组织生殖细胞较想一想的DNA双方效应组（图4A）。在这当中，雌生长荷尔蒙的刺激后DNA双方效应组中的ESR1曾加了30倍（图4B）。总得来说一，在1,814个定量分析的淀粉酶质-DNA双方效应中，约有9%屏幕上显示出高于2倍的重要影响，并看到与ESR1体现了双方效应的淀粉酶如POLR2A和SMARCA4等（图4B-C）。

图4 雌二醇类处理乳房增生癌组织细胞 DNA 彼此功能组的一定量相当（图源：Trendel, et al., Cell 2025）

总结

探究开始人类基因遗传组的蛋清质以理解它是怎么样去 被获取并付诸实现的，一种是科研管理工作员同一个常年的创造。人类基因遗传组可及性包括以DNA为心中的角度来实用探究，但，到现有就要，复染质抑菌凝胶中的一些蛋清质与DNA 形成物理学相护间用尚不了解。实用零距光热塑，可会发现DNA相护间用组中的基本上数蛋清质，XDNAX工艺将做蛋清质-DNA相护间用探究的专业工貝。

拜谱总结

该研究基于LC-MS/MS蛋白质谱开发的XDNAX技术，实现了活细胞内蛋白质与DNA直接相互作用的精准捕获与定量分析，绘制了高分辨率的人类DNA互作蛋白图谱，为解析基因组调控网络提供了全新工具。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司，可提供完善成熟的蛋白质组学、体现组学、分解代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系，整合多组学数据进行深入挖掘分析，全面解析机制机理等，助力高分文章发表。欢迎咨询！

参考资料文献综述：

Trendel J, Trendel S, Sha S, Greulich F, Goll S, Wudy SI, Kleigrewe K, Kubicek S, Uhlenhaut NH, Kuster B. The human proteome with direct physical access to DNA. Cell. 2025 May 14:S0092-8674(25)00507-0. doi: 10.1016/j.cell.2025.04.037.