
2024年9月由东莞农林一本大学张万刚教受团队图片在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱生物技术为该研究提供了亚硝基化修饰语组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文版主题词:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
期刊论文:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2023年决定成分:5.7
收录时刻:2024年9月
买家部门:南京农业大学
研发装修材料:蛋白
拜谱可以提供技术设备:亚硝基化修饰组学
技術行车路线:
一、研发毕竟
01.Caspase-3催化活性
阶段尚不知晓NO对caspase-3的可以抑定制用需不需要归因于NO介导的S-亚硝基化,不一样渗透压等度的GSNO看做外源性NO产生,以诱惑caspase-3的身体之外S-亚硝基化。结杲说明,与未GSNO的组相对比,100、200和400μM GSNO组的caspase-3渗透性取得减少(图1),与前者有关报道不对。GSNO除理减少caspase-3渗透性的意向原因分析仍仍待系统阐述。
图1 有差异质量浓度的GSNO整理对caspase-3活力性的导致
02.Caspase-3的S-亚硝基化度
探究Caspase-3的亚硝基化地步,以说明GSNO对Caspase-3的发应性。经GSNO清理后,测试到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化刚度新增(图2)。这部分结论呈现,外源性GSNO培训可成功率促进caspase-3的身体之外S-亚硝基化。可笑目瞪口呆的是,在没得GSNO长期存在的對照组中测试到1个忽闪的S-亚硝基化带,这呈现caspase-3或许发现内源性的S-亚硝基化。除外,本探究中caspase-3的S-亚硝基化地步较高,而caspase-3的渗透性大幅度降低,这与过后的探究不一样。显然,caspase-3的特男人S-亚硝基化修饰语位点尚不模糊,还要有进一歩的宇宙探索。
图2 GSNO治理对caspase-3S-亚硝基化能力的引响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化装饰组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。黄色标出图片的字段写出法S-亚硝基化肽,鲜红色标出图片的C写出法S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱仪
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结蛋白酶
结核蛋清身为1种比较至关重要的生殖血细胞骨架核蛋清,在维护肌生殖血细胞空间结构的的空间结构的系统性和收缩毛孔性个方面起着比较至关重要用途,科研S-亚硝基化caspase-3对结核蛋清化学溶解的强烈性还极具比较至关重要实际意义。与Std(未用胱天核蛋清酶-3和GSNO孵育的默认肌食物玻纤核蛋清)组不同之处,0 μM GSNO组(肌原食物玻纤和caspase-3的孵育,无GSNO)的系统结核蛋清含水量的强势减轻,系统提示caspase-3对结核蛋清还极具隐性的核蛋清溶解能力素质。在GSNO孵育后,系统结核蛋清的含水量的比较突出加入(P < 0.05)。另外,当GSNO浓硫酸浓度提升时,系统结核蛋清的含水量的不断上浮(P < 0.05)(图5)。某种会发现证明,SNO绘制的caspase-3以横向根据的形式调节结核蛋清的化学溶解。
图5.S-亚硝基化caspase-3降解塑料结球蛋白
05.S-亚硝基化Caspase- 3光降解肌钙淀粉酶-T
肌钙核球蛋清-T (TnT)是原肌球核球蛋清调结负责任健身肌肉膨胀的丝条的必不可少肌原食物合成玻纤核球蛋清。TnT的化学化学挥发塑料优点是论文检测工具到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化标准下,caspase-3对TnT的化学化学挥发塑料条件下图6随时,与Std组(含有caspase-3和GSNO的肌原食物合成玻纤)比起,caspase-3组中30 kDa TnT场面描写相关性增长,证实caspase-3参与性了TnT的化学化学挥发塑料,然而,caspase-3与GSNO的孵育导至30 kDa TnT下降。在100和200 μM GSNO组之中不能论文检测工具到分明的不一致性(P > 0.05),而当GSNO的含量起到400 μM 时,该场面描写相关性下降(P < 0.05)。以下发现证实了SNO呈现的caspase-3对TnT化学化学挥发塑料的减缓效用。结核球蛋清和TnT是caspase-3的刺激性底物,而GSNO正确处理减少caspase-3的抗逆性概率导至肌原食物合成玻纤核球蛋清化学化学挥发塑料程度上减少。表明表明,NO诱骗的S-亚硝基化可利用呈现半胱氨酸残基来调结caspase-3的抗逆性,而能进1步干扰其对结核球蛋清和TnT的核球蛋清电离程度,于是干扰牛肉片品控。
图6. S-亚硝基化caspase- 3挥发肌钙蛋清-T
二、总结
本调查主要是研究综述S-亚硝基化对caspase-3突显的应响极其紧接着对鸡肉肌原钎维离体化学降解的应响。核蛋清S-亚硝基化可突显caspase-3的半胱氨酸残基,得以形成caspase-3灵活性大幅度降低,进步骤减缓了其对鸡肉肌原钎维核蛋清的核蛋清油脂水解学习能力。三、拜谱个人总结
探讨运用了酶活查测法,亚硝基化表达组学探讨,WB等查测科技手段,会发现淀粉酶S-亚硝基化能否表达caspase-3的半胱氨酸残基,这以至于了caspase-3活力性的调低,齐头并进两步促使了其对鸡肉肌原人造纤维淀粉酶的淀粉酶溶解学习能力。本探讨为解释清楚淀粉酶质亚硝基化对肉嫩的政策调控工作机制给予一个新的第一人称视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球氨基酸组学、装饰球氨基酸组学、新陈代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系类物品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺过酸、total防氧化还原故宫场景、自由巯基,欢迎大家咨询!
考生文章:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663