
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
钻研结局
理论研究工人探索发生变化要在冷冻室保存时期缩短羊肉的强度、持水、光泽度、被氧化钙的硫含量铁的硫含量、ROS、脂质过被氮化合物、MDA、GSH和GPX4级别来分析评估力量企业体细胞系的铁死亡者工作状态。导致显视,要在冷冻室保存时期缩短后,羊肉的强度在第5天和第6天重要的削减;持水作用削减;样色变深,有了光泽度,鲜鲜网红改成暗鲜网红。除外,被氧化钙的硫含量铁、特异性氧和MDA的的硫含量重要添加,体细胞系凋亡率重要增高。 深入研究分析一下人转化成各种要在冷藏室保存时的力量仿品的淀粉酶质,以后实施SDS-PAGE研究分析一下,淀粉酶质条带在各种时分布区更加均匀且类似的(图1a)。按照其淀粉酶在各种仿品中的体现原因,研究分析一下察觉相同的组仿品的中四位数靠近于相同的总体水平(图1b),讲解力量仿品淀粉酶质含有好的的组内类似的性和组间不同性。 核血清酶质组学共检验结论结论出1996种核血清酶质。以B0为差表组,选择B1、B2、B4和B6中的核血清酶做相互影响理解具体介绍,共检验结论结论到376个DEPs。将火山图大数据可视化,并选择FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.053个规则具体介绍DEP。后果如图是1c-f如图所示,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别检验结论结论出22、33、73和140个DEPs,这当中别调整6、11、32和84个,调低16、22、41和53个。聚类分析法的方式考核了异同食品冷藏时段腿部脂肪组织化中核血清酶质的理解,后果显视腿部脂肪核血清酶理解相互影响随之存贮时期的加大而加大(图1g)。
图1| 各种要在冷藏室保存用时的胸肌样品管理球营养物质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 区别冷藏箱精力的健身肌肉仿品差别的蛋白质分享(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁伤亡蛋白酶肽的PRM一定量探讨(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 针对KEGG聚集对比分析描述淀粉酶的铁意外死亡工作机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物技术提供了TMT酶联免疫法淀粉酶质组学技能精准服务项目,拜谱生物制品已创新到位并建造了改进成孰的转录组学、淀粉酶组学、新陈代谢组学或者几组学聯合车辆技能精准服务项目制度,欢迎致电咨询!
参考价值论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.